一、流行原因
1、种鸡带毒垂直传播雏鸡，也就是说通过种蛋垂直传播
2、弱毒疫苗使用的鸡胚污染了衣原体，造成制造的疫苗带菌，通过免疫弱毒疫苗接种了衣原体。
二、发病日龄
   肉仔鸡的发病日龄主要集中于两个日龄段,第一日龄段落18-25日龄,第二日龄段28-35日龄,在2004年有的鸡群已提前到13-14日龄.产蛋鸡育雏期的发病日龄同肉仔鸡基本相似,也主要集中于这两个日龄段,也有的鸡群出现在开产前的100-120日龄和开产后的140-180日龄两个阶段,在2004年的5月前9月以后,产蛋鸡的发病不分日龄段,有首发,也有复发.2004年有的鸡群已提前到11-13日龄.2005年1月份开始,在山东地区1日龄刚接的雏鸡就开始发病，16日龄开始呈发病高峰。
三、临床症状
1、肺炎型
    肉仔鸡在18日龄出现衣原体病，3-5天后出现死亡高峰，发病率为30-80%。主要症状是呈现喘式呼吸（伸颈呼气，缩颈吸气），一部分鸡只出现单侧性眼睛流泪，鸡发蔫，刚发病时死亡率较低。晚上听鸡群的呼吸道症状，吵杂的蛙鸣音，呼噜声响亮，尖叫，怪叫，强咳。从开始发病到大群需要5天左右的时间，冬天一般3-5天，夏天7-10天的时间，5天内发病前期主要排亮绿色粪便，5天后排白色稀便的增多，死亡增加。肉鸡主要集中在肺脏，细支气管，胸气囊。发病前期一侧肺脏有白色纤维素性渗出物，胸气囊混浊。发病后期另一侧肺脏也出现白色纤维素性渗出物，严重者形成黄色干酪物，此时形成包心包肝，在心脏和肝脏上形成黄而厚的包膜，出现大批死亡。（由于出现的呼吸道时间在20日龄左右，大部分兽医师把该病同肾传支混淆或同支原体病混淆。肉鸡出现呼吸道病后较易激发大肠杆菌，进而出现球虫血痢，所以在投药上形成误区，一般的做法是：呼吸道药物+大肠杆菌药物+抗病毒药物+抗球虫药物。有的鸡群用对肾脏有损害的药物，例如庆大霉素，丁胺卡那等饮水治疗，出现肾脏肿大，更加加重了鸡群的死亡率，并且极易误诊为肾传支）。
   产蛋鸡在育雏期，育成期发病症状基本上同肉雉鸡一样，但通常不易激发大肠杆菌，治疗时比较容易。其症状如下：喘式呼吸，单侧性眼睛流泪（育雏期多见，育成期较少），蛙鸣音，排亮绿色粪便，白色稀便（较少），肺炎。
    产蛋鸡产蛋期发生衣原体病在呼吸道上分两种情况。第一，在育雏，育成期没有发生过衣原体病的鸡群，其症状同育雏育成鸡一样：喘式呼吸，单侧性眼睛流泪，蛙鸣音，亮绿色粪便。第二，前期发生过衣原体病的鸡群。主要表现在蛙鸣音和亮绿色粪便上。
    产蛋鸡在产蛋上主要表现在产蛋率下降约10-20%，个别严重的鸡群下降到30-40%，发病率达到30-40%，死亡较少。如果治疗不及时或者治疗方法错误，呼吸道在20天左右治愈，则产蛋率恢复不到原先的产蛋水平，一般最多恢复到85%左右，损失很大。
    产蛋鸡发生衣原体病蛋率下降规律：发病的前三天蛋率基本不变，蛋壳颜色逐渐退色，呈土黄色，三天后产蛋率急剧下降，7天左右的时间下降到60%左右，严重的鸡群下降到40%左右。 
    产蛋鸡发生衣原体病蛋壳变化情况：白壳蛋，软壳蛋，沙壳蛋多，小蛋（无黄蛋）畸形蛋少。（而新城疫，H9等病毒病在蛋壳上的变化除了白壳蛋，沙壳蛋，软壳蛋多以外，小蛋，畸形蛋也比较多）
2、水肿型
    水肿型的症状主要是由于在育雏，育成期发生过严重的呼吸道型衣原体病，由于诊断错误，未治疗好，呼吸道在30天左右才恢复的鸡群，在产蛋期部分鸡群表现为外观腹部肿胀，呈企鹅状，压迫有积水感觉。病变主要集中在卵巢和输卵管，早期表现在子宫腔出现轻度水肿，个别鸡在此时仍然产蛋，但蛋壳颜色退色，卵巢有发育正常的6-7个接近成熟的卵黄，中期液体增多，后期渗出液体增多，蛋黄漂浮如同水煮样。此时成熟的卵黄就不能排出，个别鸡开始感染沙门氏菌和大肠杆菌，卵黄掉到腹腔里形成卵黄性腹膜炎，被误诊为沙门氏菌和大肠杆菌，按此法治疗没有效果，且腹膜炎的死亡率高。这样的鸡群产蛋率一般在70-80%，个别鸡群产蛋率在60%就停滞不前，没有产蛋高峰。
3、无卵巢，无输卵管型

有的产蛋鸡在产蛋期没有输卵管，有的没有卵巢，有的既没有输卵管也没有卵巢。
四 、确诊依据
1、 取发病鸡只的肺脏，子宫和输卵管水肿液涂片检查出现亮绿色颗粒。
2、检验依据：由军事医学科学院微生物检验中心提供的衣原体特异性诊断试纸盒（单克隆抗体免疫荧光法）。
3、衣原体鉴定程序：将涂有标本的玻片放入标本缸中，以甲醇固定10分钟，取出后于空气中充分挥发，用记号笔于背面划一小区，加热衣原体荧光抗体20毫升，放入湿盒中密盖，置37度温箱孵育30分钟，用缓冲液冲洗（每2毫升缓冲液母液加1000毫升蒸馏水，氯化钠18.5克及吐温80   0.5毫升，即为冲洗用缓冲液）甩干，滴加缓冲甘油，加盖玻片封存，再加一滴缓冲甘油作为镜油，于荧光显微镜下检查。
结果：标本镜下查见亮绿色，具有典型大小，边界清晰的圆形颗粒，柱状细胞内可见亮绿色包涵体，可报告为衣原体荧光抗体染色阳性
五、防治措施
1、 一旦污染鸡场，一定要设定合理的用药程序。北京中农康泰科技发展有限公司的中农杆菌必治、中农百菌消，对该病有很好的预防和治疗作用。
2、 产蛋期出现子宫囊肿的鸡及时淘汰，没有治疗价值。
3、 制定合理的免疫程序：2001-2004年，实验用的衣原体基因工程外膜蛋白灭活菌苗，经临床使用能够较好的预防该病，15-20日龄首免，0.4毫升每只，颈部皮下注射。开产前100日龄二免，0.5毫升每只，颈部皮下注射，能安全的度过整个产蛋期。
六 、衣原体与支原体的区别
1、 衣原体呼吸道发病严重，呼噜，强咳，尖叫。支原体轻微的呼噜，声音小，轻微的咳嗽。
2、 衣原体前期有单侧性肺炎，严重时出现黄色或白色纤维素性渗出物，后期双侧性肺炎，形成黄色或白色纤维素性渗出物，支原体则没有肺炎。
七、 衣原体与肾传支（产蛋鸡变异传支，生殖型传支）的区别：
     衣原体是子宫输卵管囊肿，液体透明状，鸡只呈企鹅状态并且透明液体逐渐增多。液体在真皮下和肌肉层之间。传支是萎缩的输卵管内含有粘液，另外目前把该病定性为传只的一些专家并没有分离到确切的冠状病毒（实际上冠状病毒很容易捕捉到，实验室五天就能分离出来）。而只是从解剖学中加以认定，猜测。
八、小结：本病特征
1、 喘式呼吸（伸颈呼气，缩颈吸气）
2、 雏鸡单侧性眼睛流泪多，育成鸡和蛋鸡单侧性眼睛流泪少
3、 呼吸道严重，呼噜声响亮，蛙鸣音，强咳，尖叫
4、 死亡鸡喉气管有粘液，肉雉鸡有黄色干酪物。
5、 发病前期单侧性肺炎，严重时肺脏出现白色或黄色纤维素性渗出物。发病后期双侧性肺炎，肺脏上出现白色或黄色纤维素性渗出物。
6、 蛋壳颜色退色，土黄色或白壳蛋，沙壳蛋多。软皮蛋，小蛋（无黄蛋）比例少，畸形蛋比例少
7、 （1）子宫囊肿鸡（大肚子）占3%左右
    （2）无卵巢和输卵管占5%左右
    （3）无卵巢占3%左右
    （4）无输卵管占3%左右
8、 输卵管长度严重萎缩，只有小手指粗，长度大约14-18厘米
9、腺胃乳头消化液分泌减少或不分泌（鸡排亮绿色粪遍的主要原因）。
10、 病菌主要存在于肺脏，肝脏，卵巢和输卵管内。
11、 肉鸡20日龄左右发衣原体病，治愈不好，30天以后腹水症的发病率高。
12 、产蛋鸡卵巢萎缩，坏死。可见葡萄皮样的病变，有的鸡卵巢呈菜花样的病变。易形成卵黄性腹膜炎。
注意：鸭子也发衣原体病，症状同鸡一样

本图来自中国农业大学 何诚